燕麥作為六倍體作物具有基因組大、重復(fù)序列含量高等特點，其基因組測序組裝一直是世界性難題。近期，以四川農(nóng)業(yè)大學(xué)和吉林省白城市農(nóng)業(yè)科學(xué)院為核心的燕麥研究團隊構(gòu)建了六倍體裸燕麥高質(zhì)量基因組圖譜，相關(guān)成果在《Nature Genetics》發(fā)表，論文的標題為“Reference genome assemblies reveal the origin and evolution of allohexaploid oat”。

研究團隊以我國裸燕麥起源中心的燕麥品種為材料，設(shè)計選用了高精確度測序的超長測序技術(shù)，選擇了栽培燕麥最可能的四倍體和二倍體祖先一起構(gòu)建其基因組作為參照，結(jié)合不同技術(shù)手段繪制出10.7Gb大小的燕麥基因組21對染色體的分子圖譜，注釋出12萬多個蛋白編碼基因，獲得了裸燕麥的高質(zhì)量參考基因組。該研究通過進一步選擇可代表燕麥屬現(xiàn)存所有基因組類型的物種，結(jié)合全基因測序、葉綠體基因組和轉(zhuǎn)錄組分析技術(shù)，深入探究六倍體燕麥的起源與亞基因組進化。

該研究作為燕麥研究邁入基因組時代的第一步，代表了植物基因組學(xué)特別是谷物基因組學(xué)的重大進展，在提升國內(nèi)燕麥產(chǎn)業(yè)競爭力、保障糧食安全、推動選育優(yōu)質(zhì)燕麥優(yōu)良品種等方面具有重要意義。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41588-022-01127-7

注：此研究成果摘自《Nature Genetics》期刊，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場，僅供參考。

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