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科學家開發一種新型微生物群體單細胞分辨率高通量空間轉錄組分析技術

    近日,美國加州理工學院研究團隊開發了一種新的高通量空間轉錄組成像方法——并行連續熒光原位雜交par-seqFISH(parallel sequential fluorescence in situ hybridization)技術,能夠在單細胞水平鑒定和觀察微生物基因表達譜和微尺度環境中的空間信息,同時利用成像系統對不同菌落核仁長度、染色體拷貝和核糖體水平等生長指標進行監測。

    研究人員利用par-seqFISH對銅綠假單胞菌的生物膜形成過程進行了研究,證實其能夠解析菌群在浮游生長狀態下代謝和毒性相關基因轉錄水平的動態變化,以及固著生長過程(生物膜)中在空間水平上的代謝異質性,揭示了微生物種群在微環境空間中存在的復雜動態。研究結果表明par-seqFISH技術能夠為微生物動態變化與生長調控機制研究提供了新的工具,并為抗菌藥研發及抗生素耐藥性研究提供新的視角。

    相關研究成果發表在《Science》雜志上,論文標題為“Spatial transcriptomics of planktonic and sessile bacterial populations at single-cell resolution”

    論文鏈接:https://doi.org/10.1126/science.abi4882

    注:此研究成果摘自《Science》雜志,文章內容不代表本網站觀點和立場,僅供參考。
 

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