細菌以菌群的形式廣泛存在于地球上,了解菌群中細菌的組成和數量,對于研究菌群功能以及菌群如何影響宿主穩態等問題至關重要。然而,目前的技術難以在單菌水平上測定菌群組成。近期,日本科學家開發了一種對菌群中單個細菌進行高通量鑒定和定量的新技術,研究成果發表在《Nature Communications》期刊,標題為“High-throughput identification and quantification of single bacterial cells in the microbiota”。
這項技術被命名為BarBIQ(Barcoding Bacteria for Identification and Quantification,細菌條形碼鑒定和定量技術),它基于16S rRNA基因測序和單細胞標簽等技術,將單個細菌細胞進行分類群鑒定,并以高通量的方式對每個分類群進行量化,且實現了單堿基精度。科研人員將該技術應用于小鼠腸道微生物群研究中,鑒定并量化了來自小鼠糞便的3.4×105個細菌細胞的810個分類群,并發現了膳食維生素A缺乏下小鼠盲腸內菌群的微小變化。
BarBIQ可以準確可視化整體菌群和單個細菌,且具有高通量的優勢,為開展菌群相關的廣泛研究提供了新的工具。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41467-022-28426-1
注:此研究成果摘自《Nature Communications》期刊,文章內容不代表本網站觀點和立場,僅供參考。
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