豬是人類獲取動(dòng)物蛋白的主要來(lái)源之一,同時(shí)也是重要的醫(yī)學(xué)研究模型。鑒于豬在農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)和科學(xué)研究中的重要性,家豬的起源馴化研究一直是國(guó)際研究的熱點(diǎn)。近期,江西農(nóng)業(yè)大學(xué)與加州大學(xué)伯克利分校等單位的一項(xiàng)聯(lián)合研究發(fā)現(xiàn),人類介導(dǎo)的滲入和選擇塑造了現(xiàn)代家豬Y染色體的多樣性,并從父系遺傳角度揭示了豬的演化歷史。研究成果發(fā)表在《Molecular Biology and Evolution》期刊,標(biāo)題為“Human-mediated admixture and selection shape the diversity on the modern swine (Sus scrofa) Y chromosomes”。
研究人員通過(guò)基因組測(cè)序并結(jié)合以往的測(cè)序數(shù)據(jù),獲取了一個(gè)包括27個(gè)品種205頭家豬個(gè)體的高質(zhì)量數(shù)據(jù)集。從103頭公豬的Y染色體上鑒定出42288個(gè)可靠的單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(SNPs),其中96.1%是新檢測(cè)到的,為從Y染色體遺傳的角度闡明豬的進(jìn)化史提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)近200年來(lái)家豬從歐洲到亞洲的三次基因滲透事件的群體遺傳學(xué)證據(jù),且與歷史記載相一致。同時(shí),研究人員發(fā)現(xiàn),與常染色體相比,歐洲血統(tǒng)的Y染色體在部分中國(guó)豬種中普遍過(guò)量富集,這一結(jié)果不能僅用性別偏倚遷移和遺傳漂變來(lái)解釋。基于研究團(tuán)隊(duì)花費(fèi)12年時(shí)間構(gòu)建的嵌合家系群體,研究人員發(fā)現(xiàn)歐洲Y單倍型與瘦肉生產(chǎn)有關(guān),因此假設(shè):人工選擇造成了歐洲Y染色體在中國(guó)豬群中的頻率增加。此外,研究人員還發(fā)現(xiàn)了蘇門答臘野豬和中國(guó)豬之間Y染色體基因交流的證據(jù)。
總之,這項(xiàng)研究從父系遺傳的角度完善了豬的群體演化歷史,對(duì)現(xiàn)代家豬Y染色體的多樣性研究具有重要意義。
論文鏈接:
https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab230/6337983?searchresult=1
注:此研究成果摘自《Molecular Biology and Evolution》期刊原文章,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場(chǎng),僅供參考。
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