葉綠體是植物將光能轉化為化學能的重要細胞器，具有獨立的基因組，隨著基因測序技術的發展，盡管已發布了海量的植物葉綠體基因組序列，但如何整合應用這些數據目前仍面臨數據命名標準不統一、數據信息不全以及較高經濟價值的物種尚未進行測序等問題。

近日，發表在《Plant Biotechnology Journal》上題為“Towards comprehensive integration and curation of chloroplast genomes”的研究中，中國科學院北京基因組研究所和中國中醫科學院中藥資源中心研究人員開發了迄今為止物種數量最多的葉綠體基因組綜合數據庫Chloroplast Genome Information Resource（CGIR）。該數據庫收錄了來自11,946個物種的19,388條葉綠體基因組序列，包括利用全國第四次中藥資源普查標本自測的718種未發表的葉綠體基因組序列，按照基因組、基因、微衛星序列、DNA條形碼、DNA特征序列五個功能模塊對數據進行組織與管理。

CGIR數據庫通過自主測序、整合公開基因組資源和人工數據審編向用戶提供了目前最全面、物種數量最多的葉綠體基因組數據。經審編的物種分類、物種功能、基因名稱與序列、分子標記等保證了數據的高度可靠，對植物系統發育、物種鑒定、葉綠體基因工程的發展均具有重要意義。

論文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36069606/

注：此研究成果摘自《Plant Biotechnology Journal》，文章內容不代表本網站觀點和立場，僅供參考。

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